吕公望就任浙江都督后发表通电：
“云南贵州广东广西各都督总司令参谋长暨上海各报馆鉴：袁氏世凯背誓食言，殃民祸国，诸公仗义，简甲兴师，攘除奸凶，肃清群慝，义声所播，天日为昭。浙省虽僻在偏隅，誓同护国。独立既倡，万众一心。屈前都督危局支持，心力交瘁，元功弗宰，让德弗居，军民同声，攀援无术。乃责公望承兹钜艰，自愧菲材，艰胜重任。只以四方多垒，元悉未除，敢惜一身，以误大局。
“兹于五月六日正式就任。区区之志，誓在搜讨义旅，为国驰驱，期与诸公东西策应，虽历危险，在所弗辞。事属同仇，义无反顾。翻云覆雨，窃所痛心，停战迁延，尤非所望。诸公首义，必宏远谟，幸锡南针，共图北首。枕戈待命，临电神驰。浙江都督吕公望。鱼。印。”
屈映光连军政.府的都督的名头都不敢要，他领导的浙江独立应该也是假独立。只是被袁世凯这一掺和，浙江的假独立反倒成了真独立，实可谓是弄巧成拙。
岑春煊早在四月初旬就已由上海到了香.港，他和袁世凯是一对老冤家，我们知道，在“丁午政潮”的那次恶斗中，岑春煊是袁世凯的手下败将。他是反袁的，一直是反袁的，民国后他也还是反袁的，而且加入了国民党。
二次革命时，曾有传说，国民党要拥他为总统以对付袁，他是真动了心，也满怀期待。只可惜二次革命失败得太快，这一次他总算赶上了直接参加倒袁的活动。
两广和西南都是他最有人脉的地区，正可以有所作为，他于是四月十九日由香.港启程前往肇庆。
岑春煊抵达肇庆后，即由两广军方联名通电推戴他为护国军都司令。五月一日两广护国都司令部成立。岑春煊为都司令，梁启超为都参谋，李根源为副都参谋。
李根源（1879—1965），字雪生，又字养溪印泉。
清光绪五年（1879年）六月六日，李根源生于云南腾越。光绪二十九年（1903年），考入昆明高等学堂。光绪三十年（1904年）十一月，入日本振武学堂与士官学校。宣统元年（1909年）九月，任云南讲武堂监督兼步兵科教官，旋升总办。民国六年（1917年）二月，任陕西省长。民国十一年（1922年）十一月，任北洋政.府农商总长。
民国十二年（1923年），因反对曹锟贿选总统，辞去其国会代表职，隐居吴中。民国二十九年（1940年）春，返回昆明就任云贵监察使职。一九六五年七月五日，李根源病逝于北京，享年八十六岁。
李根源是辛亥元老，中国近代史上的着名人物，曾参与领导云南起义，参加“二次革命”反袁世凯称帝活动和“护法”斗争等革命运动，在修建英雄冢，倡导建设“腾冲国殇墓园”，在昆明“重九起义”云南军都督府建立等作出过重大贡献。
新中国成立后的一九五零年六月，李根源应中.央.人.民.政.府的邀请，列席政.协全.国委员会第一届全体会议。后被选为中国人民政.治.协.商会议全国委员会委员和全国政.协文史资料研究委员会副主任。
一九五九年，李根源将在抗战期间从苏州寓所疏散到小王山所收藏的全部古籍书画文物以及故意沉在小王山关庙前小池塘中的唐墓志九十三方，无保留地捐给苏州市文物管理会。
两广都司令部成立后，岑春煊陆荣廷梁启超等就打算把护国讨袁的重心由滇黔移到两广，计划筹组一个中.央机构。
五月八日，梁启超一手筹划的护国军中.央机构军务.院宣告成立，以代行北.京.国.务.院的职权，军.务.院的组织规则如下：
第一条：军.务.院直隶大总统，统筹全国军机，施行战时及善后一切政务。
第二条：大总统不能亲临军.务院所在地时，一切军政民政对内对外事宜，以军.务院名义行之。
第三条：军务院置抚军，无定员。以抚军议决或同意行其职权。抚军以各省都督或护理都督全省以上联合军都司令都参谋及各独立地方成军有二师以上之军总司令任之。凡新取得前项资格者，同时取得抚军资格。
第四条：军.务院由抚军互选抚军长副长各一人。抚军长执行抚军议决及同意之事项。抚军得赞襄抚军长协理一切。抚军长有事故时，副长摄行职权。抚军长副长俱有事故时，得公推抚军代摄行职权。
第五条：军务院置政务委员会，由抚军互选一人领委员长。设各种委员，无定员，分掌外交财政军政法制各项政务。
第六条：军务院置各省代表会，由各省都督各派二员列席，以备咨询。
第七条：军务院置秘书，无定员，承抚军长副长政务委员之命，掌管机要事宜。
第八条：军务院遇有关于对内对外特别重要事宜时，由抚军之合议或同意得特任专使处理之。
第九条：军务院所属各种委员会各省代表会组织细则，以院代定之。
第十条：军务院自国.务.院依法成立时撤废之。
原来拟议中的抚军长是岑春煊，其后决定推唐继尧。因为云南唐继尧是护国首义之人，又是实力派，由唐继尧为抚军长更合适些。这样，岑春煊便出任副抚军长。
军务院设于肇庆，唐继尧远在昆明，便由岑春煊以副抚军长代理抚军长。并推刘显世陆荣廷龙济光梁启超蔡锷李烈钧陈炳焜为抚军。
抚军资格规定为独立各省都督及军长以上的实力派，梁启超则是特殊的例外，是实力派以外的人。因为是倒袁的首创者，又是护国精神领袖蔡锷的老师，所以他很自然地成为军务院中的政.务委员会委.员.长。
军务.院直隶大总统，这里所谓的大总统当然不是袁世凯。大总统不能施行职务时，由军务院代行，军务院置各省代表会，由各省都督派代表二人列席。以唐绍仪为外交代表，王宠惠和温宗尧为副代表。
唐继尧遥任抚军长后，通电中外，略谓：“迫于时艰，勉膺重任，谨掬血诚，誓以公心效忠国事，一俟大难削平，即当退避贤路。”
蔡锷是反对设立军务院的，当五月初旬两广筹组军.务院时征求滇黔意见，蔡即复电认为目前只须迫袁退位，而由段祺瑞出面主持。“不宜组.织政.府，致招争权夺利之嫌，而启南北分裂之渐”。
蔡锷的想法和当年朱元璋“缓称王”的思想是相通的。是想明白的告诉世人，他们大家挺身而出反对袁氏称帝，是为了扞卫共和，为了护国，而不是为争权夺利。
军务.院成立后，发表第一号宣言：
“中华民国大总统领海陆军大元帅一职，依法应由副总统黎公继任，已由本军政.府宣言在案。但黎公今方陷贼围，未克躬亲职务。查《大总统选举法》第五条第二项云：大总统因故不能执行职务时，以副总统代理之。副总统同时缺位，由国,务.院摄行其职。今大总统身体蒙难，副总统职尚虚悬，国.务.院又非俟大总统任命，经国会同意后，不能组织。
“而军事正亟，既当求统一之方，至国运方新，尤宜作通筹之计。今由继尧等往复电商，特暂设一军.务院，直隶大总统，指挥全国军事，筹办善后。军务院置抚军若干人，用合议制裁决庶政。其对外交涉，对内命令，皆由本院名义行之。俟国.务.院成立时，本院即当裁撤。除将军务.院组织条例别行公布外，特此布告中外，咸使闻知。”
军.务.院各首领就任宣言：
“北京黎大总统，云南贵州南宁广州杭州都督府，泸州护国军第一军总司令部南宁护国军第二军总司令部及护国军各地前敌总司令，各省将军巡按使巡阅使镇守使，各师旅长，各道尹县知事，暨两广各团体各报馆公鉴：
“护国军军政.府宣言如下：本军政.府设置军务.院，权理军国重事，业经宣言，并将组织条例公布在案。今于五月八日组织军务.院成立，遵照条例，以继尧显世荣廷济光春煊启超锷烈钧炳焜等任军务院抚军，并往复通电，互选继尧为抚军长，春煊为抚军副长，启超领政务委员长，暂定广东为军务院所在地。
“继尧因云南地方职守未能远离，依条例第四条第二项由春煊摄行抚军长职权。继尧等菲德庸才，迫于时艰，勉肩生任，谨掬血诚，誓以公心效忠国事。一俟大难削平，即当退避贤路，皇天后土，实鉴斯言。为此布告中外，咸使闻知。再，浙江都督吕公望，遵依条例应任抚军，因交通阻梗，电商未复，除专电敦请加入外，合并声明。云南都督唐继尧贵州都督刘显世广西都督六荣廷广东都督龙济光，两广护国军都司令岑春煊两广护国军都参谋梁启超护国军第一军总司令蔡锷护国军第二军总司令李烈钧广西护国都督陈炳焜。青。印。”
护国军军务院的成立，表示护国倒袁有了统一的领导和协调机构。?
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